㈠ 如何用OMIM查找单基因遗传病的总数
在NCBI网站,选择OMIM(PUBMED下面),输入基因名称,你会获得许多关于该基因的信息,其中就包括染色体定位。
㈡ 同时存在一个omim是什么意思
OMIM 数据库:可查询任何遗传病、性状或基因的资料;这是已经在数据库,有资料吗?
㈢ 怎样在OMIM数据库中查找与某种疾病有关的基因急用,谢谢
你直接上OMIM搜索GBM就是,下面就出来了跟它相关的基因啊
㈣ 在NCBI上怎么找到一个基因的外显子和内含子
事实上,在NCBI有很多种办法可以确定某个基因的外显子或者内含子,当然还有UTR区域。今天我们来介绍NCBI的其中一个使用软件Splign来在NCBI上找到一个基因的外显子和内含子。操作步骤如下:
1.在Gene数据库,填入基因名HNF-4,我一般的话习惯叫Symbol,每个基因都有个Symbol,即基因名。
㈤ 如何在网上查找一个疾病的所有相关基因
除了文献以外,也可以考虑OMIM数据库http://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim
这个数据库的宗旨就是收集疾病及其相关基因的信息的。不过可能存在的问题就是对于疾病的划分比较系统详尽,不是说输入个糖尿病就直接出来一个列表,它对疾病进行了更进一步的分类,需要你仔细看一看,而且对于疾病的描述是很详尽的,不只是简单一个列表,需要你仔细读完,然后才能了解到底有什么相关基因。不过好处就是相当于简化了你找综述得步骤,而且相对比较全面。
㈥ 怎么查h19 icr区 基因序列
在NCBI上的OMIM数据库输入基因名,在TITLE上就会显示它的学名。 用学名检索基因是比较靠谱的。建议用ENSEMBL找基因,显示其外显子和内含子。进入ENSEMBL的方法有两种,1.NCBI上进入基因的检索条以后,summary里会有相应的ENSEMBL的链接(see related);2.直接进入ENSEMBL主页检索该基因。进入基因的检索条以后,点左侧的CDNA和EXONS就能相应地看到转录本的注释信息,包括外显子和内含子的注释,5‘和3’UTR的注释,和密码子的注释。
㈦ 如何在NCBI上查到某个给定基因的序列,并且在序列中清楚的显示出其中的外显子和内含子
1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列。在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节。
2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置,这些信息就显示了所有的外显子。处于外显子两端的序列就是内含子。
3、如你需要完整的基因序列,需要在blast中选择others这个数据库,然后查找相关的Bac质粒中含有你完整基因的文件,在其中找到你所需的信息。
㈧ 如何在NCBI上查找某个基因在染色体的位置,例如显示出在第几号染色体。。基因序列什么的都清楚,就是不...
在NCBI网站,选择OMIM(PUBMED下面),输入基因名称,你会获得许多关于该基因的信息,其中就包括染色体定位。
㈨ 如何利用NCBI查询蛋白质等电点
NCBI无法查询蛋白质等电点,可以到swissprot查询。
这个NCBI没有相关的功能,这个是以核苷酸序列为主。因为等电点特性是蛋白质水平的分子特性,可以到swissprot进行查询,查询蛋白质等电点需要到专业的平台进行查询。
另外NCBI开发有Genbank等公共数据库,提供Pubmed、BLAST、Entrez、OMIM、Taxonomy等工具,可对国际分子数据库和生物医学文献进行检索和分析。
(9)怎么在omim网站上查资料扩展阅读:
NCBI开发用于分析基因组数据和传播生物医学信息的软件工具。NCBI支持与推广多种医学及科技方面的数据库,如:三维蛋白质结构的分子模型数据库(MMDB)、孟德尔人类遗传(OMIM)等。
另外使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。可以进入NCBI后选择ConservedDomain中的Search。
除此之外这个网站Search的黄色部分其中CD-search只能提交单条序列,BatchCD-Search可以上传多条序列,里面收录的数据范围是比较广的,可以利用NCBI进行检索。
㈩ 我已经在NCBI上用omim搜索到一批需要使用的基因了,怎么进行序列进行批量下载呢或者其他批量下载方法。
OMIM数据库之父Victor Almon McKusick先生是位临床医生。该数据库的最原始的版本是一本叫MIM的遗传学书籍,后来挪到了网上,就加了一个“O”称为在线的人类孟德尔遗传学。所以OMIM数据库不同于其他的NCBI数据库。其设计之初是为临床医生提供在线浏览的服务,因此没有相应的序列下载服务。从另外一个角度来说,OMIM的每一条记录讨论的是某一个基因,而与这个基因相关的序列可能有几条,几十条甚至上百条的记录。
要解决你的问题,如果数量不多,例如50以内。建议你手工通过OMIM提供的RefSeq的链接获取。这个方法的优点是,你可以挑选你想要的序列(mRNA, DNA或Protein),消耗的时间上与编程差不多。
如果超过100,或需要反复做,就有编程的必要。你可以参考我提供的链接使用eUtils工具来获取序列。