A. 把JAVA的程序放到网站里
.java文件是java的源文件，这个在使用时是不必要的。.class文件相当于java的执行文件，这个是必须的。
把java类运用到网页中，我知道的基本有以下几种方式。
1.如果你做的计时器是一个applet，有界面的，那么把这个class放到和你的html或者jsp文档同目录中，然后在需要引用改applet的地方写下如下代码:
<APPLET code="c1_2.class" width=150 height=100></APPLET>
这个方式最简单。
2.要引用java类程序，我觉得你应该是使用jsp页面吧～，如果是jsp页面，jsp中有<jsp:useBean/>方法，你要看一下，这个不是一两句话能说清楚的。里面可以设置模式为applet，也可以直接把你的java applet类引入页面。
3.注意，毕竟java和jsp还是有区别的。如果要做什么特效，用javascript我觉得比较方便。用java做的gui界面除了applet能引入网页，其他的好像不能，至少我没见过。
class文件在jsp技术中叫做bean，所以jsp中所有和bean有关的技术都可以使用特定的class文件。比如java bean的useBean，用struts等框架，用ejb（一种特殊的bean）等等，还可以用servlet，servlet可以直接使用一种特定类型的class文件，不过要用servlet做界面，悬。
如果真想用java相关技术做网页的话，还是先学学jsp吧。这是最简单的。